一觉醒来一只眼睛肿了还疼，可能是由以下原因引起的：
1.麦粒肿：是睫毛毛囊附近的皮脂腺或睑板腺的急性化脓性炎症，可表现为眼睑局部红肿、疼痛。
2.睑腺炎：又称麦粒肿，是一种感染性疾病，通常由细菌感染引起。
3.眼部过敏：如果接触到过敏原，如花粉、尘螨、化妆品等，可能会导致眼部过敏，出现红肿、疼痛、瘙痒等症状。
4.眼眶蜂窝织炎：是眶内软组织的急性化脓性炎症，可由全身感染性疾病引起，也可因眶周结构的感染直接扩散而来。
5.其他原因：如眼部外伤、泪囊炎、急性泪腺炎等也可能导致眼睛肿胀和疼痛。
如果出现这种情况，建议及时就医，进行详细的眼部检查，以确定具体原因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意眼部卫生，避免揉眼，避免用眼过度，保持充足的睡眠。
对于儿童、老年人、糖尿病患者等免疫力较弱的人群，如果出现眼睛肿胀疼痛，应特别重视，及时就医，以免延误病情。此外，如果眼睛肿胀疼痛伴有视力下降、眼红、分泌物增多等症状，应立即就医。在就医前，应避免自行使用药物治疗，以免掩盖病情。