打完疫苗后发烧39度，可能是以下原因引起：
1.疫苗不良反应：疫苗作为一种外来抗原，进入人体后可能会引起免疫反应，导致发热。这种发热通常是暂时的，体温可能在1-2天内自行恢复正常。如果体温超过38.5℃，可以服用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚。同时，要注意多喝水，以补充因发热导致的水分流失。
2.感染：打完疫苗后，身体的免疫力可能会暂时下降，此时容易感染细菌或病毒，从而引起发热。此外，还可能伴有其他症状，如咳嗽、流涕、咽痛等。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医，进行相关检查和治疗。
3.其他潜在疾病：打完疫苗后，原有潜在疾病可能会被诱发或加重，从而引起发热。例如，患有结核病、免疫系统疾病等患者，打完疫苗后可能会出现发热等症状。如果有相关疾病史，应及时告知医生。
需要注意的是，每个人的体质不同，对疫苗的反应也可能不同。如果打完疫苗后出现发烧39度等异常症状，应及时就医，以便明确原因并采取相应的治疗措施。同时，在接种疫苗后，要注意观察身体状况，如有异常应及时告知医生。此外，接种疫苗后要注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持饮食清淡，多喝水。