肩膀疼是一种常见的症状，可能由多种原因引起。以下是一些可能导致睡一觉起来肩膀疼的常见疾病：
1.肩周炎：肩周炎又称肩关节周围炎，俗称凝肩、五十肩。以肩部逐渐产生疼痛，夜间为甚，逐渐加重，肩关节活动功能受限而且日益加重，达到某种程度后逐渐缓解，直至最后完全复原为主要表现的肩关节囊及其周围韧带、肌腱和滑囊的慢性特异性炎症。肩周炎是以肩关节疼痛和活动不便为主要症状的常见病症。
2.颈椎病：颈源性肩周炎，又称“冻结肩”、“漏肩风”、“五十肩”，是颈椎病的一种类型。主要是由于颈椎间盘退行性改变，颈椎骨质增生，或颈椎正常生理曲线改变后刺激或压迫颈神经根、颈部脊髓、椎动脉、交感神经而引起的一组综合症状。
3.肩部肌肉劳损：如果肩部肌肉过度使用或受到损伤，如长时间保持一个姿势、提重物等，可能会导致肌肉劳损，引起肩膀疼痛。
4.风湿性关节炎：风湿性关节炎是一种常见的急性或慢性结缔组织炎症。可反复发作并累及心脏。临床以关节和肌肉游走性酸楚、重著、疼痛为特征。属变态反应性疾病。是风湿热的主要表现之一，多以急性发热及关节疼痛起病。
5.肩袖损伤：肩袖是覆盖于肩关节前、上、后方的肩胛下肌、冈上肌、冈下肌、小圆肌等肌腱组织的总称。肩袖损伤主要表现为肩关节疼痛、无力、活动受限等，常在上臂外展、上举、外旋等动作时加重。
总之，睡一觉起来肩膀疼可能是多种疾病的表现，如果疼痛持续不缓解或加重，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。