慢性胃肠炎合并甲减的治疗方法如下：
1.治疗慢性胃肠炎：
一般治疗：调整饮食，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，以及高纤维食物。同时，要注意饮食的规律和卫生。
药物治疗：根据症状的严重程度，医生可能会开处方使用抗酸药、胃黏膜保护剂、促胃肠动力药等。
2.治疗甲减：
补充甲状腺激素：通常使用左旋甲状腺素钠进行替代治疗，以维持甲状腺功能正常。治疗剂量需要根据个人情况进行调整，定期复查甲状腺功能以确保剂量合适。
其他治疗：针对甲减可能引起的其他症状，如疲劳、畏寒等，医生可能会给予相应的治疗建议。
需要注意的是，治疗方案应根据个人具体情况制定，包括症状的严重程度、甲状腺功能的具体情况以及其他健康问题等。在治疗过程中，患者应遵循医生的建议，按时服药、定期复查，并注意饮食和生活方式的调整。如果对治疗有任何疑问或担忧，应及时与医生沟通。此外，保持良好的心态和积极的生活方式对疾病的管理也非常重要。