肌肉骨骼问题
肩周炎：好发于50岁左右人群，女性相对多见，常因长期过度活动、姿势不良等致肩关节周围肌肉、肌腱、滑囊和关节囊等软组织慢性炎症，表现为后背肩胛骨区域疼痛，且肩关节活动受限，早期呈阵发性疼痛，逐渐发展为持续性，可影响夜间睡眠。
背部肌肉劳损：长期伏案工作、重体力劳动或不良坐姿等生活方式人群易患，如办公室职员长时间保持低头含胸姿势，会使后背肩胛骨周围肌肉持续紧张，代谢产物堆积，引起疼痛，一般为酸痛，休息后可缓解，但劳累后加重。
颈椎病：多见于长期低头看手机、电脑的人群，年龄跨度较大，颈椎病变可压迫神经根，导致神经根支配区域出现疼痛，其中就包括后背肩胛骨部位，还常伴有上肢麻木、无力等症状。
外伤因素
肩胛骨骨折：多因直接暴力撞击，如车祸、高处坠落等，受伤部位疼痛明显，局部可有肿胀、淤血，活动肩胛骨时疼痛加剧，若为儿童，需考虑是否存在暴力损伤情况，儿童骨骼相对脆弱，外伤后更应重视肩胛骨骨折的可能。
胸腔内部疾病
胸膜炎：各种原因引起的胸膜炎，如感染、自身免疫性疾病等，炎症刺激胸膜可导致后背肩胛骨附近疼痛，疼痛往往与呼吸有关，深呼吸或咳嗽时疼痛加重，同时可能伴有发热、咳嗽等症状。
肺部疾病：如肺炎、肺癌等，肺部病变累及胸膜时可引起后背肩胛骨疼痛，肺炎患者多有发热、咳嗽、咳痰等症状，肺癌患者除疼痛外，还可能有消瘦、咯血等表现，长期吸烟人群患肺癌风险较高，需重点排查。
其他原因
胆囊疾病：胆囊炎、胆结石等胆囊疾病有时可引起右后背肩胛骨下疼痛，疼痛可向右肩部放射，常与进食油腻食物有关，这是因为内脏神经牵涉痛所致。
心理因素：长期精神紧张、焦虑的人群可能出现躯体化症状，表现为后背肩胛骨疼痛，疼痛程度可轻可重，与情绪变化密切相关，通过心理疏导等方式可能有所缓解。