一、宿主因素
年龄因素：儿童免疫系统发育尚不完善，尤其是婴幼儿，更容易发生肺部真菌感染；老年人随着年龄增长，机体免疫功能衰退，呼吸道黏膜防御功能减弱，也较易罹患肺部真菌感染。例如，有研究发现，老年人群中肺部真菌感染的发生率相对较高，与老年人基础疾病多、长期使用免疫抑制剂等因素相关。
基础疾病影响：患有糖尿病等代谢性疾病的患者，高血糖环境有利于真菌生长繁殖；患有恶性肿瘤的患者，因接受化疗、放疗等治疗，会导致机体免疫功能严重受损，粒细胞减少，呼吸道黏膜屏障功能破坏，从而增加肺部真菌感染风险；患有慢性阻塞性肺疾病（COPD）等肺部基础疾病的患者，呼吸道局部防御功能下降，也易发生肺部真菌感染。
免疫功能低下：长期使用糖皮质激素、免疫抑制剂等药物的患者，会抑制机体的免疫反应，使机体抵御真菌的能力下降；艾滋病患者由于免疫系统被HIV严重破坏，是肺部真菌感染的高危人群，常见的有肺孢子菌肺炎等。
二、真菌接触因素
环境暴露：长期处于潮湿、阴暗环境中，真菌容易滋生，增加了接触真菌的机会。比如在一些潮湿的地下室、老旧的建筑物中，可能存在大量真菌孢子，长期暴露其中的人群肺部真菌感染风险升高。
医疗操作相关：长期住院患者接受气管插管、气管切开、机械通气等侵入性操作时，破坏了呼吸道的自然防御屏障，使得真菌容易侵入肺部；接受广谱抗生素治疗的患者，可能会导致体内菌群失调，从而继发真菌感染，其中就包括肺部真菌感染。